Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms