Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms