Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP2BPQ9P2M1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms