Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABI3Q9P2A4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms