Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ2Q9P299 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPZ2Q9P299 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms