Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms