Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms