Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms