Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms