Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms