Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN4Q9NRL3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms