Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO5CQ9NQX4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO5CQ9NQX4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms