Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRD7Q9NPI1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms