Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC17Q9NP64 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms