Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms