Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3GQ9HC16 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms