Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms