Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms