Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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