Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms