Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPSB1Q96BD6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms