Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2Q8WZ74 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms