Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms