Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms