Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms