Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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