Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL3Q8N8U3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms