Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSAMQ8N6F7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSAMQ8N6F7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms