Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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