Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms