Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms