Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms