Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms