Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACS1Q6VY07 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACS1Q6VY07 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms