Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBR1LQ6UX01 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms