Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSSK4Q6SA08 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms