Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LLGL2Q6P1M3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms