Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE12Q6L8Q7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE12Q6L8Q7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms