Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms