Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms