Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms