Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
RIF1Q5UIP0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIF1Q5UIP0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms