Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms