Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms