Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms