Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms