Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms