Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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GEN1Q17RS7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GEN1Q17RS7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GEN1Q17RS7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GEN1Q17RS7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GEN1Q17RS7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GEN1Q17RS7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GEN1Q17RS7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GEN1Q17RS7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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