Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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