Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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